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- 2018年1月8
生命科学领域已迈入计算规模化时代。过去十余年间,英伟达构建了完整的 GPU 加速计算体系,涵盖硬件、框架、库、模型、微服务及特定领域工具,旨在协助研究人员处理更复杂的流程并加快迭代速度。
本周,Anthropic 推出了 Claude Science,这是一个面向科学研究的 AI 工作台,允许科学家通过自然语言与代理进行对话,从而端到端地完成其工作。
Claude Science 集成了 NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit,作为科学家在其工作流程中可访问的资源。该工具包将英伟达的加速能力打包成可调用的技能,使 Claude Science 能够选择合适的工具、准备有效的输入并执行工作流程——同时连接到部署在任何地方的英伟达计算资源。这使得英伟达的加速模型、库和 NVIDIA NIM 微服务能够直接集成到研究发生的同一环境中。
全球顶尖的制药公司正在利用英伟达技术推动药物发现、基因组学、医学影像、分子设计和蛋白质工程等领域的 AI 驱动研究。目前,排名前 20 的制药公司中有 18 家在使用 NVIDIA BioNeMo,这凸显了其在整个生态系统中的广泛作用。
推动科学发现的代理时代
Claude Science 使科学家能够使用自然语言将研究意图转化为行动,而无需手动配置模型、端点或软件环境。NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit 通过提供对 Evo 2、Boltz-2 和 OpenFold 3 等加速工作流程和模型的访问,进一步扩展了这一能力,从而加快了受益于加速的分析速度。
科学家首先以自然语言描述一项研究任务,例如分析基因组序列、预测蛋白质结构或设计潜在的结合剂。Claude Science 会解析请求,并通过预配置的、了解基因组学、蛋白质组学、单细胞分析、化学信息学和临床研究领域既定工作流程的领域专业代理来协调工作。
BioNeMo Agent Toolkit 为这些代理提供了连接每个步骤与相应英伟达科学能力的上下文。每个技能都包含其目的和所需输入的信息,有助于代理准备和执行工作流程,并返回结果供审查。
最终结果是科学推理与加速计算工作之间的迭代循环。科学家可以检查输出、完善问题并确定下一步,同时专注于科学本身。
一个强大的例子是生成更好的常见癌症靶向抑制剂。在这个工作流程中,科学家从已知的致癌抗原突变开始,然后要求 Claude 设计多种潜在的抑制剂。Claude Science 集成了 BioNeMo Agent Toolkit 和 NVIDIA NIM 微服务,加速了高通量抑制剂的预测、优化和验证。
为代理构建的科学基础
AI 代理通过推理、规划和使用工具来完成任务。在生命科学领域,这些工具通常是专业的计算工作流程。
自主的 AI 科学家代理并非孤立地进行推理。它可能需要对化合物库进行指纹识别、对有希望的命中进行聚类、为顶级候选分子生成构象、分析基因组背景以及比较扰动反应,然后才推荐下一步实验。
每个步骤都依赖于一个科学工具,而代理的工作速度仅限于这些工具的运行速度。
NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit 为科学代理提供了以科学速度运行所需的加速工具。它包括:
NVIDIA BioNeMo Agent Toolkit 是开放且与硬件无关的,允许相同的科学技能在不同的代理框架和研究平台之间协同工作。该工具包及其技能现已通过 NVIDIA 开发者资源和 GitHub 提供。
科学家们可以通过 Anthropic 的 Claude Science 访问 BioNeMo 驱动的工作流程,该服务今天开始进入公开测试阶段。作为公开测试的一部分,Anthropic 邀请研究人员就他们需要的其他领域专家和集成提供反馈。